Después de la 4 guerra ninja, Naruto recibe un mensaje de su amigo Sasuke solicitando su ayuda pero no en ese mundo, con la indicación de su amigo termina en el mundo humano de equestria, donde se entera que alguien quiere destruirlo, ellos de verán unir sus fuerzas para salvar ese mundo y a la vez recuperando la amistad que perdieron hace tiempo.